Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ATP7AQ04656 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
ATP7AQ04656 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms