Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBE1Q04446 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBE1Q04446 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms