Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	DSN1	YIR010W	1731 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	APL4	YPR029C	2499 nt		4.12	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	AEP3	YPL005W	1821 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	SKP2	YNL311C	2292 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	TRX3	YCR083W	384 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	RDI1	YDL135C	609 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YGR026W	YGR026W	837 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	ARG80	YMR042W	534 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	RPS10B	YMR230W	318 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	SUT2	YPR009W	807 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	TIM12	YBR091C	330 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YBR242W	YBR242W	717 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	TRM12	YML005W	1389 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YIG1	YPL201C	1386 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	ULP1	YPL020C	1866 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	JIP5	YPR169W	1479 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	RIT1	YMR283C	1542 nt		4.11	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	TRS120	YDR407C	3870 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	CAT5	YOR125C	702 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YOR263C	YOR263C	408 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	FDH2	YPL275W	711 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YBR137W	YBR137W	540 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	PGS1	YCL004W	1566 nt		4.1	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	CTM1	YHR109W	1758 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YNR063W	YNR063W	1824 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YDR250C	YDR250C	276 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	BSC2	YDR275W	708 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	RPS18A	YDR450W	441 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	LSM12	YHR121W	564 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	PET130	YJL023C	1044 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	AUR1	YKL004W	1206 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	YOR114W	YOR114W	885 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	RPS11B	YBR048W	471 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	MUM2	YBR057C	1101 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	SWI1	YPL016W	3945 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	SDS23	YGL056C	1584 nt		4.09	□□□□□ -1.75
SYF1	Q04048	GRS2	YPR081C	1857 nt		4.09	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YPR003C	YPR003C	2265 nt		4.09	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	GAC1	YOR178C	2382 nt		4.09	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	KIP3	YGL216W	2418 nt		4.09	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	HSP42	YDR171W	1128 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YDR355C	YDR355C	303 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YGR018C	YGR018C	330 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	SEC65	YML105C	822 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	DSF2	YBR007C	2211 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	CAF20	YOR276W	486 nt		4.08	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	DAP2	YHR028C	2457 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RRN7	YJL025W	1545 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	SER3	YER081W	1410 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YKL050C	YKL050C	2769 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	MCD4	YKL165C	2760 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	OAF3	YKR064W	2592 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	SOL3	YHR163W	750 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	MRPL49	YJL096W	486 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	GCD14	YJL125C	1152 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YLR042C	YLR042C	486 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YLR311C	YLR311C	348 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	CTL1	YMR180C	963 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	NTH1	YDR001C	2256 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	MSR1	YHR091C	1932 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	EXO5	YBR163W	1758 nt		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	MEK1	YOR351C	1494 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RPS13	YDR064W	456 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	FCF1	YDR339C	570 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	WBP1	YEL002C	1293 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	POG1	YIL122W	1056 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	USB1	YLR132C	873 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YLR156W	YLR156W	345 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YLR159W	YLR159W	345 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YLR161W	YLR161W	345 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	MED11	YMR112C	396 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	COS1	YNL336W	1146 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RPS9B	YBR189W	588 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	CUE3	YGL110C	1875 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	PTM1	YKL039W	1572 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	SEC59	YMR013C	1560 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RPB2	YOR151C	3675 nt		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	SMI1	YGR229C	1518 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	ALG1	YBR110W	1350 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	FMP25	YLR077W	1752 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RRI1	YDL216C	1323 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YGR117C	YGR117C	1431 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YTM1	YOR272W	1383 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	TSR1	YDL060W	2367 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YRM1	YOR172W	2361 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	DTD1	YDL219W	453 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	ISC10	YER180C	804 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	FMP10	YER182W	735 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RTA1	YGR213C	954 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	COX23	YHR116W	456 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	MBB1	YJL199C	327 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	UTP23	YOR004W	765 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RPA43	YOR340C	981 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	OXR1	YPL196W	822 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RPN4	YDL020C	1596 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	ORC4	YPR162C	1590 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	STE23	YLR389C	3084 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RIM4	YHL024W	2142 nt		4.04	□□□□□ -1.76

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