Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms