Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL6Q02878 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms