Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms