Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APBA1Q02410 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms