Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRCDQ00LT1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms