Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK17Q00537 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK17Q00537 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms