Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRB1P82279 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRB1P82279 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRB1P82279 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRB1P82279 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CRB1P82279 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRB1P82279 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRB1P82279 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRB1P82279 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRB1P82279 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRB1P82279 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CRB1P82279 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRB1P82279 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRB1P82279 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRB1P82279 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRB1P82279 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CRB1P82279 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CRB1P82279 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRB1P82279 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRB1P82279 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRB1P82279 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRB1P82279 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRB1P82279 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRB1P82279 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRB1P82279 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRB1P82279 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CRB1P82279 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRB1P82279 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRB1P82279 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRB1P82279 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRB1P82279 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRB1P82279 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRB1P82279 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRB1P82279 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRB1P82279 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRB1P82279 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRB1P82279 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRB1P82279 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRB1P82279 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRB1P82279 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRB1P82279 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRB1P82279 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRB1P82279 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CRB1P82279 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRB1P82279 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRB1P82279 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRB1P82279 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRB1P82279 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CRB1P82279 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRB1P82279 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRB1P82279 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CRB1P82279 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRB1P82279 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRB1P82279 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRB1P82279 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRB1P82279 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRB1P82279 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CRB1P82279 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CRB1P82279 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CRB1P82279 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRB1P82279 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CRB1P82279 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CRB1P82279 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRB1P82279 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRB1P82279 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms