Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHC1P78364 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHC1P78364 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHC1P78364 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHC1P78364 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHC1P78364 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHC1P78364 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHC1P78364 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHC1P78364 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHC1P78364 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHC1P78364 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHC1P78364 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHC1P78364 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHC1P78364 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHC1P78364 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms