Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms