Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D2P62837 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D2P62837 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms