Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF3P57682 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF3P57682 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF3P57682 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF3P57682 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF3P57682 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms