Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBASH3AP57075 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms