Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RWDD2BP57060 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms