Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3BP55884 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms