Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms