Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NRLP54845 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRLP54845 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRLP54845 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRLP54845 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRLP54845 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRLP54845 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRLP54845 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRLP54845 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRLP54845 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRLP54845 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRLP54845 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRLP54845 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms