Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYS2P54840 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GYS2P54840 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GYS2P54840 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYS2P54840 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYS2P54840 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYS2P54840 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYS2P54840 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYS2P54840 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GYS2P54840 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GYS2P54840 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GYS2P54840 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GYS2P54840 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GYS2P54840 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GYS2P54840 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms