Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNHP51946 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNHP51946 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNHP51946 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNHP51946 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNHP51946 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNHP51946 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNHP51946 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNHP51946 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNHP51946 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNHP51946 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNHP51946 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNHP51946 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNHP51946 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNHP51946 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNHP51946 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNHP51946 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNHP51946 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNHP51946 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms