Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP11P51784 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP11P51784 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP11P51784 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP11P51784 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP11P51784 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP11P51784 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP11P51784 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP11P51784 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP11P51784 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP11P51784 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP11P51784 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP11P51784 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms