Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE6CP51160 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms