Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms