Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP4P49662 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP4P49662 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP4P49662 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP4P49662 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP4P49662 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP4P49662 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP4P49662 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP4P49662 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP4P49662 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP4P49662 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP4P49662 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP4P49662 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP4P49662 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP4P49662 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP4P49662 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP4P49662 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms