Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTPAP49638 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTPAP49638 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTPAP49638 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTPAP49638 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTPAP49638 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTPAP49638 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTPAP49638 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTPAP49638 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTPAP49638 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTPAP49638 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTPAP49638 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTPAP49638 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTPAP49638 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTPAP49638 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTPAP49638 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTPAP49638 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTPAP49638 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTPAP49638 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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