Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC10P48553 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC10P48553 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC10P48553 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms