Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LSSP48449 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LSSP48449 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSSP48449 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSSP48449 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSSP48449 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSSP48449 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSSP48449 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LSSP48449 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LSSP48449 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSSP48449 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LSSP48449 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LSSP48449 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSSP48449 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSSP48449 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSSP48449 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSSP48449 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSSP48449 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSSP48449 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LSSP48449 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSSP48449 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LSSP48449 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LSSP48449 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSSP48449 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSSP48449 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LSSP48449 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSSP48449 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSSP48449 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSSP48449 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSSP48449 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSSP48449 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSSP48449 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSSP48449 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSSP48449 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LSSP48449 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LSSP48449 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms