Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA4P48058 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms