Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRB2P47870 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms