Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA1P42261 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA1P42261 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms