Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLH1P40692 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MLH1P40692 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MLH1P40692 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MLH1P40692 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MLH1P40692 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH1P40692 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH1P40692 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH1P40692 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH1P40692 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH1P40692 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH1P40692 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH1P40692 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH1P40692 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLH1P40692 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLH1P40692 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLH1P40692 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLH1P40692 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLH1P40692 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLH1P40692 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLH1P40692 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH1P40692 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH1P40692 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH1P40692 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms