Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 CSR2YPR030W 3366 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 IRC6YFR043C 714 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YJR111CYJR111C 852 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 RPS28BYLR264W 204 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YBL065WYBL065W 345 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YPL162CYPL162C 822 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 DIB1YPR082C 432 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 MET16YPR167C 786 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YBR096WYBR096W 693 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 RNR1YER070W 2667 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YSP2YDR326C 4317 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 SPO71YDR104C 3738 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 ABD1YBR236C 1311 nt3.18□□□□□ -1.9
DDI1P40087 HDA2YDR295C 2025 nt3.17□□□□□ -1.9
DDI1P40087 MCM21YDR318W 1107 nt3.17□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YIL025CYIL025C 375 nt3.17□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YIR040CYIR040C 333 nt3.17□□□□□ -1.9
DDI1P40087 HSH49YOR319W 642 nt3.17□□□□□ -1.9
DDI1P40087 NUP60YAR002W 1620 nt3.17□□□□□ -1.9
DDI1P40087 EXO70YJL085W 1872 nt3.17□□□□□ -1.9
DDI1P40087 SIZ1YDR409W 2715 nt3.16□□□□□ -1.9
DDI1P40087 GRX3YDR098C 858 nt3.16□□□□□ -1.9
DDI1P40087 PDS1YDR113C 1122 nt3.16□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YOS1YER074W-A 258 nt3.16□□□□□ -1.9
DDI1P40087 COX19YLL018C-A 297 nt3.16□□□□□ -1.9
DDI1P40087 YIG1YPL201C 1386 nt3.15□□□□□ -1.9
DDI1P40087 HAP4YKL109W 1665 nt3.15□□□□□ -1.9
DDI1P40087 AIP1YMR092C 1848 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YCL076WYCL076W 744 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YDR161WYDR161W 1164 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YGL152CYGL152C 678 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 CDC12YHR107C 1224 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 ERP1YAR002C-A 660 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 CMD1YBR109C 444 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 MRPL37YBR268W 318 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RAD4YER162C 2265 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RSF2YJR127C 4143 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YPR148CYPR148C 1308 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 TMA108YIL137C 2841 nt3.15□□□□□ -1.91
DDI1P40087 MIG1YGL035C 1515 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YKR015CYKR015C 1707 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 FRQ1YDR373W 573 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 DUO1YGL061C 744 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 UTP11YKL099C 753 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RAD10YML095C 633 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 ASI2YNL159C 870 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YBL094CYBL094C 333 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 CPR8YNR028W 927 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RFM1YOR279C 933 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RAD2YGR258C 3096 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 GIS4YML006C 2325 nt3.14□□□□□ -1.91
DDI1P40087 TRE2YOR256C 2430 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 TGL3YMR313C 1929 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 CHK1YBR274W 1584 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RPS29BYDL061C 171 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 NSE3YDR288W 912 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YHR173CYHR173C 339 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 CAB2YIL083C 1098 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 UNG1YML021C 1080 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 MED11YMR112C 396 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 SPC24YMR117C 642 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 TPM1YNL079C 600 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YOR082CYOR082C 342 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 POL2YNL262W 6669 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 VPS33YLR396C 2076 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 DRS2YAL026C 4068 nt3.13□□□□□ -1.91
DDI1P40087 SSL1YLR005W 1386 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 SDS23YGL056C 1584 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 MAL12YGR292W 1755 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 MAL32YBR299W 1755 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YDR133CYDR133C 336 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 CNN1YFR046C 1086 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 LSM1YJL124C 519 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 FLD1YLR404W 858 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 TAF4YMR005W 1167 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YPR077CYPR077C 372 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 SNT1YCR033W 3681 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 ERG9YHR190W 1335 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 STP1YDR463W 1560 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RSC1YGR056W 2787 nt3.12□□□□□ -1.91
DDI1P40087 TOP1YOL006C 2310 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 TCP1YDR212W 1680 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RRM3YHR031C 2172 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 DET1YDR051C 1005 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 SCL1YGL011C 759 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 IRC18YJL037W 675 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 BUR2YLR226W 1188 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 OCA2YNL056W 594 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 IZH2YOL002C 954 nt3.11□□□□□ -1.91
DDI1P40087 snR63snR63 255 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 MGT1YDL200C 567 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 RRP8YDR083W 1179 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YDR391CYDR391C 699 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 TLG1YDR468C 675 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YGR026WYGR026W 837 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 PET54YGR222W 882 nt3.1□□□□□ -1.91
DDI1P40087 YAL069WYAL069W 315 nt3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms