Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX5P35711 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX5P35711 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX5P35711 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX5P35711 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX5P35711 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX5P35711 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX5P35711 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX5P35711 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX5P35711 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX5P35711 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX5P35711 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX5P35711 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX5P35711 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX5P35711 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX5P35711 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX5P35711 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX5P35711 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX5P35711 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX5P35711 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX5P35711 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX5P35711 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX5P35711 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX5P35711 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX5P35711 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX5P35711 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX5P35711 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX5P35711 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX5P35711 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX5P35711 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX5P35711 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX5P35711 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX5P35711 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX5P35711 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX5P35711 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX5P35711 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX5P35711 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX5P35711 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms