Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms