Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA3P35244 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA3P35244 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPA3P35244 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA3P35244 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA3P35244 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA3P35244 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA3P35244 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA3P35244 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms