Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPC1P35052 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPC1P35052 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPC1P35052 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPC1P35052 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPC1P35052 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPC1P35052 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPC1P35052 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPC1P35052 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC1P35052 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC1P35052 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC1P35052 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms