Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	YGL088W	YGL088W	366 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGR190C	YGR190C	366 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	MRPL16	YBL038W	699 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	FIG1	YBR040W	897 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	CTP1	YBR291C	900 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RAD54	YGL163C	2697 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	AEP3	YPL005W	1821 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	PEX30	YLR324W	1572 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YLR152C	YLR152C	1731 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RTC5	YOR118W	1704 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	NTH1	YDR001C	2256 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RAD28	YDR030C	1521 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	OCA4	YCR095C	1089 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YDL027C	YDL027C	1263 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	TAF10	YDR167W	621 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	DPP1	YDR284C	870 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	TYW3	YGL050W	822 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	SCM4	YGR049W	564 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	PRP38	YGR075C	729 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RPL8A	YHL033C	771 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	PET130	YJL023C	1044 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YLR217W	YLR217W	324 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	ECM13	YBL043W	774 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YNR071C	YNR071C	1029 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RRG7	YOR305W	729 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RFC5	YBR087W	1065 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RIA1	YNL163C	3333 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	SDS23	YGL056C	1584 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	DSN1	YIR010W	1731 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	TCO89	YPL180W	2400 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	CTM1	YHR109W	1758 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RSC3	YDR303C	2658 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RRP3	YHR065C	1506 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	ECM22	YLR228C	2445 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	DPB4	YDR121W	591 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGL109W	YGL109W	324 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	CUE3	YGL110C	1875 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGL194C-A	YGL194C-A	243 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	TAN1	YGL232W	870 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGR115C	YGR115C	780 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	FOL2	YGR267C	732 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	ACP1	YKL192C	378 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	PAM18	YLR008C	507 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	SEC59	YMR013C	1560 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	UBP8	YMR223W	1416 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	NIS1	YNL078W	1224 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	PEX15	YOL044W	1152 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YOR186W	YOR186W	435 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	FLC1	YPL221W	2382 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RAD18	YCR066W	1464 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	MTL1	YGR023W	1656 nt		3.9	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	SIP1	YDR422C	2448 nt		3.9	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	NHX1	YDR456W	1902 nt		3.9	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	MON1	YGL124C	1935 nt		3.9	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	CPR4	YCR069W	957 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	BSC2	YDR275W	708 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YFL064C	YFL064C	525 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YGR026W	YGR026W	837 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	SWD2	YKL018W	990 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	GPX1	YKL026C	504 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YAL044W-A	YAL044W-A	333 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	MAP1	YLR244C	1164 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	TPM1	YNL079C	600 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	SPR2	YOR214C	711 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	VPS73	YGL104C	1461 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	POL1	YNL102W	4407 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	TAF8	YML114C	1533 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	RRB1	YMR131C	1536 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	PRP3	YDR473C	1410 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	GAL11	YOL051W	3246 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YDR134C	YDR134C	411 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	MPC3	YGR243W	441 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	GAT4	YIR013C	366 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YJL147C	YJL147C	1149 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	GLO1	YML004C	981 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	NOC2	YOR206W	2133 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	BUD5	YCR038C	1929 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	GCD1	YOR260W	1737 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	SHE9	YDR393W	1371 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YCR023C	YCR023C	1836 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	DSL1	YNL258C	2265 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	CDC14	YFR028C	1656 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	HRR25	YPL204W	1485 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YDR491C	YDR491C	492 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	MIG2	YGL209W	1149 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YIL024C	YIL024C	570 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	CAP1	YKL007W	807 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	MIC27	YNL100W	705 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	RGS2	YOR107W	930 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YBR242W	YBR242W	717 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	STP22	YCL008C	1158 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	MAG2	YLR427W	2013 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	YNL011C	YNL011C	1335 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SIP1	P32578	KGD1	YIL125W	3045 nt		3.88	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms