Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms