Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA3P32297 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms