Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCKSP29966 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCKSP29966 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms