Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTX3P26022 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTX3P26022 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTX3P26022 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTX3P26022 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTX3P26022 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTX3P26022 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTX3P26022 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTX3P26022 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms