Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPS6KB1P23443 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms