Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA1P20936 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA1P20936 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASA1P20936 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASA1P20936 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RASA1P20936 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RASA1P20936 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA1P20936 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA1P20936 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA1P20936 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA1P20936 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA1P20936 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA1P20936 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASA1P20936 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASA1P20936 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASA1P20936 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA1P20936 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA1P20936 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA1P20936 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA1P20936 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA1P20936 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASA1P20936 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms