Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC3P19447 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC3P19447 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms