Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYN1P17600 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYN1P17600 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYN1P17600 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYN1P17600 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYN1P17600 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYN1P17600 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYN1P17600 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYN1P17600 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYN1P17600 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYN1P17600 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYN1P17600 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SYN1P17600 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYN1P17600 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYN1P17600 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYN1P17600 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYN1P17600 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYN1P17600 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYN1P17600 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYN1P17600 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYN1P17600 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms