Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOT1P17174 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOT1P17174 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOT1P17174 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOT1P17174 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOT1P17174 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOT1P17174 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOT1P17174 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOT1P17174 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOT1P17174 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOT1P17174 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOT1P17174 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOT1P17174 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOT1P17174 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GOT1P17174 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOT1P17174 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOT1P17174 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOT1P17174 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOT1P17174 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOT1P17174 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms