Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTLA4P16410 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTLA4P16410 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms