Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCFC2P16383 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCFC2P16383 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms