Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRAP16234 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms